复旦大学附属中山医院内分泌科为国家临床重点专科，博士学位授予点和博士后流动站。现有教授和主任医师9名，其中博士生导师8名。病床61张，年出院患者4500人，年门诊量24万人次。诊疗疾病种类齐全，涵盖140余种内分泌代谢疾病。在国内率先开展质谱法检测醛固酮等20余种内分泌激素，在国内较早建立肥胖、脂肪肝、内分泌肿瘤等亚专科，先后成立中山医院甲状腺疾病诊疗中心和肥胖与脂肪肝诊疗中心，牵头和参与制定10余部内分泌代谢疾病诊疗指南与共识。为整合与促进学科的发展，先后成立了复旦大学代谢病研究所，复旦大学代谢疾病临床交叉研究院，以及成为教育部代谢与分子医学重点实验室单位。承担了科技部重点专项、国家自然科学基金重点项目、国际合作重点项目，以及国家优青，海外优青等人才项目，牵头全国多中心临床研究20余项，已培养博士生60余名、硕士生90余名，博士后8名。在国际一流期刊JAMA，Nature Medicine, JAMA Internal Medicine, Cell Metabolism等发表论文100余篇。中国医院科技量值（STEM）学科影响力位居前六，复旦大学医院专科声誉榜位居前十。

复旦大学附属中山医院闵行院区（上海市老年医学中心）内分泌科成立于2023年，是本院重点发展的临床学科之一。科室依托于复旦大学附属中山医院内分泌科的雄厚实力，受到垂直化、同质化的管理，致力于为患者提供高品质、全方位的内分泌代谢疾病诊疗服务。科室现开放床位24张，有主任医师1名，主治医师7名，住院医师1名。科室常规开展内分泌常见病、疑难病及危重病的诊治，并重点建设了一系列特色专病门诊，包括：甲状腺专病门诊、糖尿病与心血管健康专病门诊、糖尿病与肝肾健康专病门诊、肥胖与体重管理专病门诊、桥本甲状腺炎综合管理门诊、脂肪肝与高脂血症专病门诊以及骨质疏松预防与治疗门诊。科室积极运用新媒体平台进行健康科普宣传，通过官方微信公众号“上海市老年医学中心内分泌科”发布医疗资讯、健康科普与科室动态，并依托视频号“老年医学中心内分泌健康说”定期推送糖尿病、甲状腺疾病等主题的科普视频，助力公众健康素养的提升。