复旦大学附属中山医院呼吸科与危重医学科是由我国著名肺病学家、防痨事业奠基人之一吴绍青教授于上世纪30年代创立的肺科发展而来，目前是上海市医学重点学科、上海市重点学科、国家临床重点专科建设项目和上海市“重中之重”学科建设项目，是上海市呼吸病研究所挂靠单位，兼管上海市呼吸内科临床质控中心，也是上海市呼吸物联网工程中心和上海市肺部炎症与损伤重点实验室挂靠单位。承担国家自然科学基金、国家攻关课题、科技部重大专项，卫生部基金、上海市科委基金、985和973子课题等项目，取得系列科技成果，包括国家、卫生部、教育部和上海市等各级成果奖。

　　较早开展临床肺功能检查和呼吸危重症的诊治，如无创通气、机械通气相关新技术开发、呼吸系统引流、肺功能测定的标准化及推广等。肺部感染诊治是学科的另一特色，尤其是免疫抑制宿主感染的诊治、耐药菌感染的诊治和医院感染的防控，肺部感染的分子诊断等。成立肺癌综合诊治中心，肺癌的早期诊断及多学科综合诊治极具特色，通过卫计委内镜培训基地评审，牵头撰写了中国和亚太肺部结节诊治指南。慢性气道疾病与呼吸危重症的救治相辅相成，慢阻肺患者稳定期康复锻炼，急性期机械通气治疗均具特色，并牵头起草了慢阻肺急性加重期诊治的国内专家共识。在肺血管病、肺间质病、睡眠呼吸紊乱及疑难病、少见病诊治等方面也具有丰富的经验。科室在转化医学推广方面初见成效，积极推进物联网医学，新药开发和干细胞治疗的落地工作。

　　本学科由14位正高(主任医师/教授/研究员)、9位博导，9位副高(副主任医师/副教授)、二十余位主治医师、住院医师和技师组成，愿景为“接轨国际，面向世界，服务病人，造福社会”，学科发展目标为：“变底层建设为顶层设计、变学术紧跟为学术引领、变实用新型为国际发明、变中国制造为智能创造”;培养了符合双一流要求的 “国际大会有声音、国际杂志有影响、国际学会有位置、国际社会有认可”国际四有团队;创立了物联网医学，并占领了物联网医学和肺结节诊治的国际制高点;展示了“顶层设计、学术引领、科技创新和智能惠众”的优势。

　　此外，密切结合疾病谱变化及我国呼吸科临床需求，形成了五大亚专科。

　　一、呼吸危重症：开始于上世纪50年代末，出版了一系列机械通气和临床肺功能专著，正在建设物联网eRICU呼吸重症监护室，开展了体外膜氧合(ECMO)、血液净化，EIT等技术。最早在国内开展无创正压通气、保护性机械通气、心肺功能监测、肺泡液体转运与肺水肿治疗。新型通气面罩的开发和救治技术的提高扩大了无创机械通气的适应证，目前在开展重症肺炎，ARDS的临床研究及药物研发和ARDS临床预警。

　　二、慢性气道疾病：提出“基于手机的云加端物联网医学”，研发出全球首个物联网PM2.5肺功能仪，物联网辅助慢阻肺管理系统，物联网+助力哮喘优化管理系统，牵头制定全球首个AECOPD共识，在国内设立20余家物联网医学示范基地，对提高同质化分级诊疗水平起到了引领作用。目前在开展物联网慢病管理，穿戴设备诊断呼吸疾病，物联网家庭无创通气和呼吸康复等工作。

　　三、肺部肿瘤和介入: 2002年1月28日建立全国首家肺部肿瘤综合诊疗中心，2007年建立肺癌靶向治疗门诊，2014年提出肺癌诊断端口前移、重心下沉的顶层设计，牵头制定“亚太肺结节评估指南”和中国首个“肺结节诊治”共识，开创了中国呼吸界牵头国际指南历史，研发BaiDX物联网肺结节诊断系统，激光共聚焦技术，物联网辅助肺癌靶向治疗管理系统。国内最早开展内科胸腔镜等用于胸膜疾病的诊断。2012年建立中国肺癌防治联盟，在全国120家大学医院与400余家地市级和县级医院建立肺结节诊治分中心，在亚太呼吸学会、斯里兰卡推广肺结节评估指南。

　　四、肺部感染: 拥有较大规模的微生物实验室，开展传统微生物学和分子诊断相结合的微生物鉴定方法、肺部感染的临床诊治、院感防控、免疫抑制宿主肺部感染的临床和基础研究，PCP血流感染的分子诊断。负责呼吸机相关肺炎的临床处理、预防控制等指导文件的制订。

　　五、间质性肺病：传承间质性肺疾病规范诊疗理念，除传统肺功能检测、支气管镜肺泡灌洗、支气管镜肺活检等诊断技术外，积极开展运动心肺功能、六分钟步行距离、支气管镜冷冻肺活检等诊断技术及间质性肺疾病呼吸康复。开设有间质性肺疾病专病门诊、肺淋巴管平滑肌瘤专病门诊，并积极推广间质性肺疾病MDD诊疗模式。先后参加多项抗纤维化药物国际及国内多中心临床研究。目前开展研究包括间质性肺疾病AI影像定量分析、探索可用于间质性肺疾病诊断或监测的新型肺功能指标及基于“诱导痰技术平台” 的生物标志物等。

　　学科同时拥有睡眠室，支气管镜室，肺功能室。其中支气管镜室同时也是国家卫生健康委基于电磁导航系统的早期肺癌精准诊疗试点单位。目前科学还有中国肺癌防治联盟，国家老年医学中心老年肺部感染与呼吸衰竭防治联盟等的挂靠单位。